Le Agenzie investigative effettuano indagini investigative di controspionaggio industriale e anti spionaggio. Le indagini investigative hanno la finalità di scoprire e individuare attività illecite di spionaggio industriale grazie a indagini di "intelligence".
In questo caso la scelta ottimale è rivolgersi ad agenzie investigative con esperienza nell'ambito del controspionaggio e con le conoscenze tecniche. Per effettuare questa tiplogia di indagine investigative nella maggior parte dei casi risulta utile utilizzare tecnologie investigative.
Le agenzie investigative effettuano bonifiche ambientali di uffici o veicoli. In caso di dubbio è possibile grazie a tecnologie investigative come i rilevatori di microspie cercare e individuare dispositivi spia come microspie ambientali o microregistratori spia. Inoltre è possibile cercare nei veicoli grazie a particolari rilevatori di microspie eventuali localizzatori satellitari utilizzati per spiare la posizione di un veicolo.